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具体来说，该化学式中各组分的含义的是：2个钙原子、6个硼原子、11个氧原子与5个结晶水分子构成了硼钙石的基本晶体结构，其中结晶水是其晶体结构的重要组成部分，这也使得硼钙石具有一定的吸水性和易风化特性。
硼钙石常与钠硼解石、硬硼钙石等其他硼酸盐矿物共生，多见于干旱地区的盐湖蒸发矿床中。需要注意区分它与钠硼解石（化学式：NaCaB₅O₉·8H₂O）的成分差异——二者虽同属硼酸盐矿物，但钠硼解石含钠元素，且硼、钙原子比例及结晶水数量均与硼钙石不同，这也导致两者在物理性质（如硬度、密度）和用途上存在细微区别。